W Tropico 5 wcielasz się w postać El Presidente, który najpierw przejmuje kontrolę nad niesławną wyspą Tropico we wczesnych czasach kolonialnych, a następnie prowadzi ją przez wieki, gdy świat się zmienia i idzie naprzód. Musisz stawić czoła zmieniającym się potrzebom swojego ludu, a także przeciwstawnym rządom i frakcjom, a tym samym położyć podwaliny pod własną dynastię. W miarę upływu lat sprawowania władzy możesz promować członków swojej dalszej rodziny na wyspie na stanowiska władzy: takie jak ambasador, generał dowodzący, a nawet Najwyższy Władca, aby zapewnić, że twoje dziedzictwo będzie się rozwijać przez kolejne epoki. Wraz ze wzrostem wpływów i bogactwa rosną zagrożenia dla rosnącego supermocarstwa na wyspie. Czy zdołasz przetrwać obie wojny światowe, prosperować w czasach Wielkiego Kryzysu, rządzić jako żelazny dyktator podczas Zimnej Wojny i rozwinąć swój kraj do czasów współczesnych i nie tylko? Od XIX do XXI wieku, każda epoka niesie ze sobą własne wyzwania i możliwości.